Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms