Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
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