Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF24Q9UPV7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PHF24Q9UPV7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms