Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RRBP1Q9P2E9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RRBP1Q9P2E9 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms