Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
RDH8Q9NYR8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms