Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms