Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KDM5DQ9BY66 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KDM5DQ9BY66 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms