Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VN1R3Q9BXE9 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VN1R3Q9BXE9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms