Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRIP1Q9BX63 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms