Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KIFC1Q9BW19 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms