Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FYCO1Q9BQS8 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FYCO1Q9BQS8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms