Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLF1Q9BQI6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLF1Q9BQI6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms