Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 NUBP1-201ENST00000283027 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 OLA1P1-201ENST00000396387 1189 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB4BP7-201ENST00000406999 1234 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL023755.1-203ENST00000422253 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01049-201ENST00000426840 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 HNRNPA1P15-201ENST00000444886 960 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 FGF12-206ENST00000450716 768 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC079193.1-201ENST00000460497 588 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 SMIM20-202ENST00000514384 774 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 RFPL4AP7-201ENST00000520120 215 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC090099.2-201ENST00000529793 681 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 EGLN3P1-201ENST00000541727 720 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 C12orf54-203ENST00000548364 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC091147.1-201ENST00000583290 510 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL691432.1-202ENST00000597891 502 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01730-201ENST00000613868 843 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 MMP13-202ENST00000340273 1470 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 MAST4-221ENST00000490016 1950 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 LIN52-205ENST00000555028 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008764.10-201ENST00000625135 1830 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 WSB1-207ENST00000579733 1670 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AC107977.1-201ENST00000355745 939 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 FCGR2B-202ENST00000358671 2115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 OR14J1-202ENST00000377160 1117 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP4-12Q9BQ66 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms