Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms