Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TMEM95-202ENST00000389982 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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GCN1Q92616 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
GCN1Q92616 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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GCN1Q92616 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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GCN1Q92616 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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GCN1Q92616 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
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GCN1Q92616 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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GCN1Q92616 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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GCN1Q92616 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
GCN1Q92616 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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