Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATAD1Q8NBU5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATAD1Q8NBU5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms