Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS8Q8N3P4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS8Q8N3P4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms