Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLIP4Q8N3C7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLIP4Q8N3C7 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms