Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PBRM1Q86U86 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PBRM1Q86U86 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms