Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP34Q70CQ2 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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