Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDZRN4Q6ZMN7 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms