Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXD4L3Q6VB84 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms