Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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