Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATL3Q6DD88 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATL3Q6DD88 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms