Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN4Q5MJ08 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SPANXN4Q5MJ08 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms