Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDCA8Q53HL2 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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