Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LIN52Q52LA3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms