Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DUSP28Q4G0W2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms