Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CCDC153Q494R4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms