Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TTLL9Q3SXZ7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTLL9Q3SXZ7 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms