Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF1Q3BBV0 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms