Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms