Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RPE65Q16518 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RPE65Q16518 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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RPE65Q16518 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPE65Q16518 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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