Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
IRF4Q15306 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms