Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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CKAP5Q14008 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CKAP5Q14008 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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