Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CUL1Q13616 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms