Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEUROD1Q13562 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NEUROD1Q13562 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
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