Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NME3Q13232 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NME3Q13232 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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