Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DUSP4Q13115 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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