Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
CHAF1AQ13111 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
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