Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GRIK3Q13003 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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