Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CSTF3Q12996 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CSTF3Q12996 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSTF3Q12996 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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