Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRIN2AQ12879 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRIN2AQ12879 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
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