Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NFIAQ12857 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NFIAQ12857 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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