Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CD300CQ08708 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AC011700.1-201ENST00000610409 2627 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CD300CQ08708 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms