Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSME1Q06323 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms