Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CALD1Q05682 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CALD1Q05682 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms