Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC105053.1-201ENST00000366278 1711 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GHRH-203ENST00000373614 570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MDH1-202ENST00000409476 808 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MDH1-203ENST00000409908 700 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 C3orf52-204ENST00000480282 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC025419.1-202ENST00000535315 744 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AP000322.2-201ENST00000608289 510 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PSMC1P11-201ENST00000405257 1317 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CEACAMP3-201ENST00000473762 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CCL28-203ENST00000513525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC104794.2-201ENST00000567540 1572 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LIAS-201ENST00000261434 1258 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 HCCAT5-202ENST00000642127 1029 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 GLT8D2-202ENST00000546436 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CACNB1Q02641 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms