Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CENPEQ02224 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms