Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERVK_113P62684 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms